Im Stadtgebiet Landshut sind derzeit zwei Wasserschutzgebiete ausgewiesen.

1. Wasserschutzgebiet Siebensee / Münchnerau

Dieses Schutzgebiet dient dem Schutz der Trinkwasserbrunnen in Siebensee, aus denen das Trinkwasser für die Versorgung der Stadt Landshut gewonnen wird. 

2. Wasserschutzgebiet Wolfsteinerau

Dieses Schutzgebiet dient dem Schutz der dortigen Trinkwasserbrunnen. Das in der Wolfsteinerau gewonnene Wasser wird vom Wasserzweckverband Isar-Vils für die Versorgung von Gebieten im Landkreis Landshut verwendet.